Imposante Brückenbauwerke gab es auf der RHB noch nie, sondern nur einige kleine Bauwerke über Wege und Strassen. Von den Überführungen fällt dem Fahrgast nur jene im Winkelsbühl oberhalb Schwendi auf.

Auf Grund des Brückeneinsturzes bei Münchenstein mussten 1894 auch die Brücken der RHB etwas verstärkt werden, wofür die VSB-Werkstätte Rorschach beigezogen wurde. Das Eisenbahndepartement verlangte den Umbau der hölzernen Überfahrtsbrücke bei km 2.275 in eine eiserne; die Bahn versprach baldige Ausführung.

1929 wurde im Hinblick auf die Elektrifikation mit den Arbeiten zur Hebung der Strassenbrücke bei der Station Wienacht von 4,75 m auf 5,10 m begonnen.

Im Laufe der Jahre mussten die Bauwerke immer wieder einmal verstärkt und instandgestellt werden. Einzelne Über- und Unterführungen mussten den Strassenverbreiterungen angepasst werden.

1969 wurde mit dem Bau der Autobahn-Überführung in Rorschacherberg begonnen, ebenso mit dem Bau der neuen Strassenunterführung im Sandbüchel. Die Autobahn mit einer Brücke über die RHB kam am 12.12.1973 in Betrieb.

Die Anordnung des ursprünglichen Oberbaues unterschied sich von der Rigibahn, indem die Längsschwellen nicht aussen an den Querschwellen, sondern in der Mitte als Unterlage der "Zahnschiene" angeordnet wurden, damit die Zahnstange erhöht wurde, um die Fahrt der Bergbahnfahrzeuge nach dem Hafenbahnhof zu ermöglichen (gleiche Anordnung wie 1871 bei der Ostermundigen-Bahn angewendet). Querschwellen waren aus Eichenholz, die Längsschwellen aus Tannenholz. Die Mauersätze in Distanzen von 135 m erstellte man nicht wie bei der Rigibahn schief gegen die Steigung, sondern senkrecht. Die Laufschienen hatten keine Unterlagsplatten. Die erste Beschotterung bestand aus Sandsteinmaterial, darüber eine zweite Schicht aus "ordentlichem Kies, stellenweise allerdings etwas schwach". Unter den Zahnschienen wurde Platz gelassen für den Schnee.

1877 wurde in Wienachten ein, allerdings nicht durchgehendes zweites Gleis angelegt, um "auch grösseren Anforderungen des Steintransportes zu genügen".

Bereits 1880 sah man sich veranlasst, den Ersatz der weichhölzernen Langschwellen durch normale Querschwellen in die Wege zu leiten. Es wurden versuchsweise einige eiserne Schwellen eingebaut und einige Langschwellen durch Eichenquerschwellen und Zahnstangensättel ersetzt. Die Schwellenauswechslung (neben den Langschwellen auch defekte Querschwellen) fand ausser auf der Strecke Wienachten – Schwendi (folgte 1885) auf der ganzen Strecke statt.

1886 musste auch der Ersatz der alten Eisen- durch neue Stahlschienen an die Hand genommen werden. Ab 1888 wurden dann aber alljährlich 600 – 700 Schwellen gegen stärkere ausgewechselt und "auch die Befestigungmittel bedeutend verstärkt".

Nach dem Übergang zu einen stärkeren Oberbau stimmte das Eisenbahndepartement 1890 der bei der RHB üblichen Zahnstangenlagerung, die es während Jahren bemängelt hatte, zu.

1895 war die ganze Strecke Bergstation - Wienachten mit den neuen Stahlschienen, allerdings nur 20 kg/m schwer, ausgerüstet.

1896 erhielt die RHB eine erste normale Weiche (bis anhin hatte sie nur "Schleppweichen")

Die Beschotterung der Strecke wurde bis etwa 1910 mit minderwertigem Material (Sandstein) vorgenommen, ab dann kam Material guter Qualität zum Einbau.

Bei den Bahnübergängen wurden ab 1916 anstelle der alten Holzabdeckungen solche aus Beton angebracht, damit die Pferde weniger ausgleiten, die Schneeräumung vereinfacht werden konnte und um das Auf- und Abklappen für die Zugsfahrten einzusparen. Die Zahnstangenlagerung konstruierte man neu, da die Lagerung mittels Holzkeilen mit zunehmendem Alter immer schlechter wurde.

1919 wurden Versuche mit "armierten Zahnstangensätteln" angestellt. Die Zähne mussten sukzessive neu genietet werden. Spurerweiterungen, die früher unzulässige Werte erreichten sowie Fehler in der Höhenlage der Zahnstange wurden nun behoben. Die selbst hergestellten Eisenbetonsättel bewährten sich nicht durchwegs, weshalb deren Anwendung wieder abgebrochen wurde. Die alljährlich wegen Verfaulen oder Zerreissen abgehenden Holzsättel wurden nun durch die zwar teureren, aber viel haltbareren Sättel aus Flusseisen Fabrikat von Roll ersetzt.

1920 notierte der Kontrollingenieur "Die Schiebebühne bei der Wagenremise Bergstation ist noch immer im gleichen verwahrlosten Zustand wie seit vielen Jahren".

Die neuen Zahnstangensättel wurden vor der Elektrifikation bis auf wenige kurze Zwischenstücke fertiggestellt. Es wurden neue Zahnstangeneinfahrten von SLM eingebaut.

Die Verkehrszunahme während des zweiten Weltkrieges gab Anlass zur Verbesserung des Oberbaues. Mit dem Ersatz des früher verwendeten, mit Sand und Erde durchsetzten Rheinkieses durch Hartschotter wurde fortgefahren. Da keine neuen Schienen in dem bei der RHB üblichen abnormalen Profil erhältlich waren wurde damit begonnen, die Schienen zu 36-m-Abschnitten zusammenzuschweissen.

Für die Gleiserneuerung Bergstation – Wienacht-Tobel wurden die nötigen Schienen 1947 angeschafft, doch musste die Auswechslung noch bis 1949 verschoben werden.

Ein Inspektionsbericht des Eidg. Amtes für Verkehr (EAV) lautete 1960 ziemlich vernichtend. Teils schlechter, teils sogar betriebsgefährlicher Zustand der Gleisanlagen. Das EAV verlangte die Reduktion des Schwellenabstandes und Erneuerung der Beschotterung auf der Strecke Wienacht – Heiden, um die zulässige Achslast auf 20 t erhöhen zu können. Die Schaffung eines durchgehenden Kreuzungsgleises in Wienacht (nebst einem zweiten Einfahrgleis in Heiden) wurde 1963 als dringend bezeichnet. Der Schienen- und Schwellenersatz wurde in der Folge zügig ausgeführt.

1982 begann erneut ein Totalumbau des Gleises mit Ersatz der Holz- durch Stahlschwellen und Einbau von Schienen des SBB-Profils I. Wegen der höheren Schienen mussten die Zahnstangensättel ersetzt werden. Dieser Totalumbau konnte nach sieben Jahren abgeschlossen werden. Das Gleis ist durchgehend verschweisst und von Holz- auf Stahlschwellen sowie Profil-I-Schienen umgebaut worden. Um 1990 mussten an den inzwischen weit über hundert Jahre alten Zahnstangen nicht mehr festsitzende Zähne neu eingeschweisst werden

Schon seit manchen Jahren wurde im Gebiet unterhalb der Station "Wienachten" Sandstein, ein im 19. Jahrhundert beliebter Baustoff, abgebaut. Der Abbau fand auf Grundstücken verschiedener Landeigentümer statt, die einander nicht immer freundschaftlich gesinnt waren. So weigerte sich der Gemeinderat Thal, dem Landeigentümer Nationalrat Sonderegger in Heiden ein Fahrrecht für ein Verbindungsgleis zu erteilen. Thal wurde dabei zunächst vom sanktgaller Regierungsrat unterstützt. Die Gemeinde befürchtete, durch das Anschlussgleis werde die Ausbeutung ihres (gemeindeigenen) Steinbruches behindert oder gar verunmöglicht. Hierauf reichte die RHB ein Konzessionsgesuch für eine regelrechte Bahnlinie ein. Der Regierungsrat von Appenzell AR unterstützte die RHB; machte lediglich einige bautechnische Vorbehalte wegen der Erdrutschgefahr. Der Regierungsrat des Kantons St.Gallen schwenkte ebenfalls ein, nachdem bekannt war, dass 1885 in einem gleichen Fall bei der RVT ebenfalls eine Bundeskonzession erteilt worden war. Die RHB verlangte eine Vollendungsfrist von zwei Jahren (statt wie vorgesehen sechs Monate), um die neue Linie sukzessive erstellen und das Ausbruchmaterial aus dem Steinbruch laufend nutzbringend verwerten zu können.

So sollte die Bedienung des Steinbruchgleises nur mit Fak.- und Extrazügen erfolgen. Die Doppelweiche vor der Waage Richtung Steinbruch und die Zahnstangenweiche wiesen Weichenschlösser auf, deren Schlüssel der "beeidigte fixangestellte Wärtervorstand" bei sich zu tragen hatte. Notfalls waren Ersatzschlüssel bei der "Stationsverwaltung Wienachten" unter Verschluss vorrätig. Die Steinzüge hatten talwärts vor und bergwärts nach den Regelzügen zu verkehren. Das Steinbruchgleis erhielt als eigene Station den Namen "Wienachten-Steinbruch". Da die kurze Strecke offiziell als Bahnlinie konzessioniert war, erschien sie nicht in den zeitgenössischen Verzeichnissen der "Verbindungsgleise zu gewerblichen und industriellen Etablissements". Die RHB rechnete mit etwa 200 Wagenladungen à 10 t pro Jahr, was zu einer erheblichen Verbesserung des Betriebsergebnisses beitragen sollte.

Die RHB sah sich 1910 genötigt, den Steinbruch Wienachten zu übernehmen, da die Steinbruchgesellschaft angesichts des rückläufigen Umsatzes in Liquidation trat. Der Kaufpreis war mit 12'000 Franken günstig, denn notfalls hätte schon die landwirtschaftliche Nutzung des Geländes den Preis gerechtfertigt.

Um etwa 1930 wurden die Steintransporte mangels Nachfrage eingestellt. Die Anschlussgleisanlage wurde 1942 aufgehoben und mit der Zeit abgebaut, Spuren davon sind aber heute noch zu finden.

An die Erstellung eines Güterausladeplatzes in Rorschacherberg leistete die RHB 1923 einen Beitrag. Der Platz diente vor allem der Maschinenfabrik des Herrn Levy, die sich etwas oberhalb der "Bergstation" befand. Bereits 1925 wurde eine Planvorlage für ein Anschlussgleis mit Zahnstangenweiche für die später in "Starrag" Starrfräsmaschinen AG umbenannte Firma mit einer Drehscheibe für das in die Werkhalle führende Gleis vorgelegt. Die Sendungen waren bis und ab Wienacht-Tobel zu tarifieren, wo auch die Abfertigung der Versandsendungen erfolgte. Die Höchstgeschwindigkeit im Anschlussgleis war auf 10 km/h beschränkt.

Das zwar heute noch bestehende, aber kaum mehr genutzte Anschlussgleis wies zeitweise einen lebhaften Verkehr auf, der teils mit Rangierfahrten in den Zugspausen, teils aber auch mit Fahrplanzügen mitsamt den geduldigen Fahrgästen an Bord abgewickelt wurde.

Das Stationsgebäude Heiden stammt im Prinzip aus dem Eröffnungsjahr, wurde aber mehrmals umgebaut, wobei man die Raumeinteilung den sich verändernden Bedürfnissen anpasste. Das Hauptgleis (anfänglich auch das zweite Gleis) war bis 1966 etwa auf der Länge des heutigen Perrondaches mit einer "Einsteigehalle" überdeckt. Auf der Seite gegen den heutigen Güterschuppen bestand eine Schiebebühne, mit der die gegenüberliegende Remise erschlossen war. Für den Güterverkehr entstand "ein Stock tiefer" eine im Laufe der Zeit erweiterte Freiverladeanlage, an die eine bescheidene Lokomotivremise angeschlossen wurde. 1930 entstand nördlich daran anschliessend die heute noch bestehende Werkstätte.

1914 erfolgte die Verlängerung der Güterrampe und des Perrons sowie die Verbreiterung der Zufahrtsstrasse von Wolfhalden zur Station Heiden.

Das Stationsgebäude Heiden erhielt elektrische Beleuchtung, Wasserversorgung und "Closets mit Wasserspülung". Ferner wurde auch ein Stationsbrunnen angelegt.

1958 begann man, einen allfälligen Neubau des Stationsgebäudes Heiden zu prüfen, wofür der dem Verwaltungsrat angehörende Architekt 1959 Pläne vorlegte. Im folgenden Jahr musste man sich dazu entschliessen, den Stationsneubau wegen des dringenden Gleisumbaues zurückzustellen. Da die Verhandlungen mit dem Kanton Appenzell AR bezüglich der Gestaltung der Strasse ins Stocken geraten waren, wurde das bestehende Stationsgebäude 1965 einer Renovation unterzogen.

Auf das Hundertjahr-Jubiläum hin wurde das Stationsgebäude erneut einer Innen- und Aussenrenovation unterzogen. Der Güterschuppen wurde 1983 frisch gestrichen und beim Kioskgebäude ein Velounterstand errichtet. Das Stationsgebäude und die WC-Anlage wurden an die Kanalisation angeschlossen.

"Bergstation"/Seebleiche

Wegen der Manöver, der Einfahrt in die Zahnstange auf der Bergstation bzw. der Anmeldung zur Einfahrt in den Bahnhof Rorschach hielten die RHB-Züge seit jeher bei der "Bergstation" mehr oder weniger lang an, was von den Anwohnern zur Fahrt mit den RHB-Zügen benützt wurde, trotzdem diese Haltestelle in den Fahrplänen nur vereinzelt erwähnt wurde.

Die Abwicklung des Verkehrs zur Starrfräsmaschinen AG bedingte 1925 den Umbau der Anlage der Bergstation, weshalb auch das baupolizeilich längst abgesprochene Dienstgebäude zu ersetzen war. Das alte Wärterhaus wurde 1926 abgebrochen und durch ein schönes Gebäude oberhalb der Bahn ersetzt. Bei der Bergstation wurde ein kleines Wartelokal erstellt mit Wartsaal, Abort und Wärterraum.

Auf den Fahrplanwechsel 1990 wurde anstelle der als Geheimtipp gehandelten Haltestelle bei der Bergstation oberhalb dem Anschlussgleis der "Starrag" die offizielle Haltestelle "Seebleiche" eröffnet. Die Kosten für das Gebäude, die elektrischen Anlagen und die Umgebungsarbeiten sowie für die Einweihungsfeier übernahm die Gemeinde Rorschacherberg. Die bei neuen Wohnhäusern gelegene Haltestelle wurde auf Anhieb monatlich von 1200 Personen benützt, die schon länger bestehende im Sandbüchel von 3000.

Um die Diensthalte bei der Bergstation für das Einholen der Einfahrtszustimmung zu vermeiden, wurde die Anmeldung der RHB-Züge beim Bahnhof Rorschach über Funk eingerichtet.

Sandbüchel

1972 konnte die neue Haltestelle Sandbüchel in Betrieb genommen werden. Damit wird das dortige Wohngebiet erschlossen, das durch die Autobahn von der Stadt Rorschach abgeschnitten ist. Die Haltestelle besteht aus einem modernen Zweckbau mit den nötigen weiteren Einrichtungen. Sie erfreute sich sofort grosser Beliebtheit. Vor der Einführungdes Taktfahrplans gab es sogar ein nur bis hieher verkehrende Zugspaar.

Ihre grosse Zeit hatte die Haltestelle anlässlich der Rad-WM 1983. Dabei beförderte die RHB rund 15'000 Besucher von Rorschach zur Rennstrecke.

Wartensee

Auf der 1934 eröffneten Haltestelle Wartensee wurde ein Haltestellengebäude mit einem Dienstraum für das Unterbringen von Werkzeugen erstellt.

1935 sah man nur noch den Halt von zwei Zügen in jeder Richtung in Wartensee vor, wobei die Zugsbelastung 40 t nicht überschreiten sollte. Bei Bedarf sollten auch andere Züge anhalten, was zu grosser Unsicherheit bei den Reisenden führte.

Während die neuen Haltestellen Seebleiche und Sandbüchel einen konstanten Verkehr aufweisen, ist jener der Haltestelle Wartensee sehr unregelmässig.

Wienacht-Tobel

1895 erfolgte die Planvorlage für einen Neubau des Stationsgebäude Wienacht; der Kanton Appenzell AR empfahl, "das Terrain an der Gleisspitze abzuschliessen"

Ein Teil des "alten, baufällig gewordenen Stationshäuschens" wurde südlich verlegt als Provisorium während der Bauzeit. Das neue Gebäude sollte "auf unabsehbare Zeiten" genügend sein. Man rühmte weiter "In Wienachten wurde ein neues Stationsgebäude an prächtigster Lage erstellt".

1910 erfolgte der Anschluss an die öffentliche Wasserversorgung Lutzenberg.

1913 wurde im Stationsgebäude Wienachten wurde ein zusätzliches Wohnzimmer eingebaut und im ganzen Gebäude die elektrische Beleuchtung eingerichtet.

1915 erfolgte die Änderung des Stationsnamen Wienachten in Wienacht-Tobel.

1923 betraute man den Vorstand mit der Führung der Poststelle.

1953 wird eine Renovation des Stationsgebäude vermerkt.

Das alte unansehnliche Abortgebäude in Wienacht wurde 1962 durch einen Neubau, dem ein Materialraum für den Bahnunterhalt beigefügt wurde, ersetzt.

1977 wurde aus Abbruchmaterial eine Schwellenremise erstellt.

Das Stationsgebäude wurde 1990 renoviert. Im Jahr darnach wurde eine Gasheizung eingebaut. Die Lagerschuppen wurden 1996 durch eigenes Personal mit eigenem Holz renoviert.

Schwendi

1902 wurde eine Vorlage für neues Stationsgebäude in Schwendi präsentiert, doch beschränkte man sich auf eine Renovation.

1909 ging man daran, im alten Stationsgebäudes Schwendi den alten Warteraumes als Güterschuppen einzurichten.

Im alten und neuen Stationsgebäude Schwendi wurde 1916 das elektrische Licht eingerichtet und ein zusätzliches Zimmer geschaffen. 1923 folgte der Bau eines Waschhauses.

1953 nahm man am Wärterhaus Schwendi Renovationsarbeiten vor, desgleichen 1971 am Stationsgebäude. Weitere Erneuerungsarbeiten konnten 1977 abgeschlossen werden. An die neue öffentliche Abortanlage trug die Gemeinde Heiden die Hälfte bei.

Die personelle Besetzung der Haltestelle wurde 1976 aufgehoben.

Mit der Erweiterung des Güterwagenbestandes (1898) und der Anzahl Personenwagen (um 1905) war man genötigt, die Remise instandzustellen und nun wieder vorwiegend für RHB-Wagen zu verwendet. Gemäss Bericht des Kontrollingenieurs wurden in der RHB-Remise in Rorschach aber auch Lokomotiven und Wagen der SBB untergebracht, weshalb die Instandstellung der Schiebebühnenzufahrt verlangt wurde

Bis 1926 war in der Bergstation nur ein Gleis von der SBB-Anlage her an die Schiebebühne angeschlossen. Es wurden nun zwei neue Weichen eingebaut und die beiden so entstandenen Gleise III und IV über die Schiebebühne in die Remise geführt. Ein zwischen der Schiebebühne und der Hauptgleisweiche stehendes Gebäude musste abgebrochen werden.

Als Ersatz für die unzureichenden Anlagen in Heiden wurden 1927 drei mit einer Schiebebühne erschlossende Räume in der 1924 aufgehobenen SBB-Werkstätte Rorschach gemietet, was sich aber kaum bewährte, da das Personal mehrheitlich in Heiden sowie in den beiden Zwischenstationen wohnte.

Die Remise Bergstation wurde in Etappen immer wieder renoviert.

1992 – 1994 erfolgte eine radikale Erneuerung, wobei die Schiebebühne und die Gleise 5 und 6 der Bergstation abgebrochen, ebenso die Wagenremise über diesen beiden Gleisen. Dafür wurden die restlichen Gleise und die Remise um 15 m verlängert. Ein Gleis wurde mit der Fahrleitung versehen. Dort wird nun die Reservelokomotive remisiert. Das Gebäude macht mit einem frischen Anstrich in kecken Farbtönen wieder einen guten Eindruck.

Die RHB besass Wohnhäuser für ihr Personal bei der Bergstation in Rorschacherberg und im Stapfen, Heiden, die aber um 1970 veräussert wurden.

Beim Bau hatte man die unglückliche Idee, das Wasserreservoir der Bergstation in das Wärterhaus zu plazieren, wodurch das ganze Gebäude unter Feuchtigkeit litt. Es wurde nun auf den nahegelegenen Hügel versetzt. In der Nähe der Bergstation wurde 1925 ein Wohnhaus erworben als Ersatz für das bisherige Wärterhaus.

Die Fahrleitung war in zwei Sektionen Rorschach Bergstation – Wienacht und Wienacht – Heiden unterteilt, letztere ab Bergstation durch Speiseleitung versorgt. Die meisten Nebengleise sind separat abschaltbar.

Es zeigte sich zunehmend, dass die Speiseleitung mit nur 50 mm2 Querschnitt zu schwach war, was sich durch zunehmend mehr Kurzschlüsse und Ermüdungsbrüche zeigte. 1972 erfolgte die Erneuerung des Tragseils Bergstation – Wienacht-Tobel. Das Seil konnte zu günstigen Bedingungen von den SBB erworben und unter deren Mithilfe eingebaut werden. 1981 folgte der Ersatz des Tragseils auf der Strecke Wienacht – Heiden.

Mit dem Schaltposten im Bahnhof Rorschach musste 1985 auch die Einspeisung für die RHB-Fahrleitung erneuert werden. 1991 wurden acht schiefgedrückte Fahrleitungsmasten durch neue ersetzt. Alljährlich müssen eine Anzahl brüchig gewordene Isolatoren ersetzt werden.

Auf Grund neuer Vorschriften mussten die Bahnübergänge 1930 mit neuen Signalisierungen versehen werden.

Auf Pfingsten 1947 wurde die Sicherungsanlage Fabrikat Integra, Wallisellen der Station Heiden in Betrieb genommen. Gleichzeitig wurde die handbediente Barrierenanlage an der Thalstrasse durch eine Blinklichtanlage ersetzt, die mit dem Einfahr- und dem Abfahrtsbefehlsignal in Abhängigkeit steht. Die Einfahrweiche erhielt eine signalabhängige Verriegelung, um Falschfahrten wie sie 1945 zur Kollision geführt hatte, zu vermeiden.

1954 erhielt Wienacht-Tobel bergseits ein Einfahrsignal. Zur selben Zeit erfolgte die Inbetriebnahme des Lichtsignales in Rorschach anstelle der elektrischen Wendescheibe. Es wurde so plaziert, dass Einfahrten von Heiden in die Bergstation möglich sind ohne dass die SBB-Fahrstrassen tangiert werden.

1955 kam das Blinklicht beim Starrag-Gleis in Betrieb. Die Sicherungsanlage der Station Heiden wurde 1970 an die neue Stationsanlage angepasst und mit neuen Blinklichtern ausgerüstet. Wegen der vielen Erdtransporte über die RHB-Linie für den Autobahnbau wurde unterhalb des Sandbüchel vorübergehend eine provisorische Blinklichtanlage eingerichtet.

Die anfänglichen Störungen an der neuen Sicherungsanlage der Station Heiden konnten 1971 behoben werden. Die neue Haltestelle Sandbüchel erhielt 1972 eine Signalanlage für Halt auf Verlangen.

Ursprünglich bestanden keine Fernmeldeanlage, dann eine Telegraphen- und schliesslich eine Streckentelefonanlage, deren Erstellung aber weder in den Berichten noch in den Rechnungen aufscheint.

Die 1930 erstellte, störungsanfällig gewordene Diensttelefonanlage wurde 1953 durch das automatische SBB-Diensttelefon ersetzt. 1985 musste wegen Erneuerung der Telefonanlage der SBB in Rorschach auch jene der RHB in Heiden ersetzt werden.

Auf allen Stationen und Haltestellen wurden 1991 Perron-Infosäulen durch eigenes Personal montiert.